年，潜伏在天津担任汪伪政权天津特务委员主任的我党地下工作者沈西林，与组织失去联系而孤立，但他从未放弃自身信仰，寻找契机获取情报。同时，原天津的中统特务、训练科科长老谭化身为天津法租界巡捕房的班头，伺机取得情报。地下组织的老周培养韩子生——已故员韩培均的养子。老周利用子生在电话局工作的条件，为父报仇的急切心理，对其训练，伺机传递情报。狠毒狡猾的日军侵华情报机关的头目武田弘一，则不顾一切地摧毁地下组织。天津上演了一幕幕惊心动魄的情报战。沈西林利用特殊身份，取得日军印制假钞、零式战斗机图纸，扫荡计划等情报，通过子生传递给我党。胜利前夕，中统与日本宪兵勾结，计划摧毁我地下情报网。沈西林得到情报，子生传给老周，老周精心布置，粉碎了敌人的阴谋。沈西林被捕押往北平。
1945年初，军统总部情报处的余则成接到重要任务，和上级吕宗方赴南京潜入汪伪政府，暗杀叛逃的李海丰。吕宗方初到南京便遭枪杀。余则成单枪匹马暗杀了李海丰，得到军统嘉奖。这时，特使突然告诉他吕宗方的实际身份是地下党。更让余则成惊讶的是，深爱的女朋友左蓝也是。根据吕宗方对余则成的评价，特使希望余加入地下党。
余则成无意中发现戴笠等人为私利而向日军泄露新四军情报，也彻底看清失去民心的原因，加上左蓝的劝告，遂弃暗投明。党组织要求他留在军统，潜伏待命，代号“峨眉峰”。余则成受命到军统天津特务站，站长吴敬中要求他把夫人接来。党组织给他派来了大方朴实、泼辣耿直的女游击队长翠平，让两人做起了假夫妻。练过功夫、枪法如神的翠平不适应吃西餐、打麻将的官太太生活，闹出不少笑话，多次强烈要求离开，二人在生活细节和性格上也冲突不断。 1946年1月，国共双方开始“军调”。余则成发现派来的军调人员中竟然有左蓝。余则成将军统在代表身边布下的监视特务名单交给左蓝，并公之于众，首战告捷。
特务站内部明争暗斗。站长动用潜伏在延安的特务“佛龛”调查左蓝和余则成的关系，行动科长马奎还抓捕了余则成的联络员秋掌柜。余则成与左蓝利用特务站陆桥山与马奎的争权夺利，将“峨眉峰”的帽子戴在了马奎头上。最后，马奎被转运时逃脱，而左蓝挖出“佛龛”，用他换回了受尽酷刑的秋掌柜。身份暴露的“佛龛”李涯分配回到天津，他提议让余则成策反左蓝，以测试余则成。得知左蓝不从，李涯决定杀害左蓝。他让马太太电话通知左蓝晚上在某地见面，马太太无奈答应，余则成让翠平中途去拦截左蓝。眼看就要成功，不料途中横杀出咆哮着寻仇的马奎，一番激战，左蓝和马奎互射身亡。左蓝的牺牲让翠平第一次看到地下斗争的残酷，开始慢慢理解余则成的潜伏工作，两人渐渐有了默契。余则成和李涯联手，几经争斗，陆桥山被迫调走，余则成晋升为天津站副站长，获得了更多情报。
本剧分为《听风》《看风》和《捕风》三个篇章，三者在时间关系及故事上相对独立，又千丝万缕。
听风，即无线电侦听者；这是一群“靠耳朵打江山”的人，他们的耳朵能听到天外之音，无声之音，秘密之音。
看风，即密码破译的人；这是一群“善于神机妙算”的人，他们的慧眼可以识破天机，释读天书，看阅无字之书。
捕风，即我党地下工作者；在大肆实施时期，他们是牺牲者，更是战斗者，他们乔装打扮，深入虎穴，迎风而战，为缔造共和国立下了不朽的丰功伟业。
故事发生在1950年秋——1952年春。这是我们的祖国军事上最吃力、国家面临最大变数之季。军事上，北边要打美国人，南方大山深处又聚集着众多残部，需要尽快一举歼灭。美朝战争的爆发，使蒋介石及众多残匪追随者又死灰复燃，的诱惑使隐藏在全国上下的特务都摩拳擦掌，企图改写中国历史。
有资料指出，当时国内有近十万特务，主要活动在各大城市，他们到处搞爆炸，破坏公众设施，散布谣言，扰乱军心民心。特务的活动当然是地下的，联络主要用的是无线电，这是他们的命脉，也是我们要粉碎特务组织的主要战线。无线电联络就怕侦听，即空中拦截。只要知道对方联络的频率和时间，任何人都可当作“第三者”抄到对方的电报。所以，为了反拦截，无线电联络经常要换掉联络频率和时间，以便甩掉侦听方。而对侦听方来说，当对方更换联络时间和频率之后，一定要尽快找到，否则侦听便成了空谈。
然后有一天，台湾本岛与大陆联系的电台一夜之间都失踪了。在茫茫然的无线电海洋里，各种电台多如鱼虾，要找到一部特定的电台，犹如在森林里寻找一片特定的树叶，其难度可想而知，不但需要你夜以继日，更需要你有一双灵敏的耳朵。
故事发生在1960年春——1962年秋。这一时期也是我们的祖国最为困难之时期，内有三年自然灾害，外有积聚多年的苏联外债要还，可谓是内忧外困。国际上，东西两大阵营对峙，冷战加剧，各国间谍多如牛毛。物质的贫乏，锁国的政策，直接引发的是人们精神世界的简单、苍白，爱情只是一种古老的习惯，一种生存的需要，而不是精神的追求。男女有别，就像社、资之别一样明确而固执，需要人人谨慎直面，不能含糊。在这种世风、这种世俗之下，一个人追求个性自由、向往美好的爱情，自然成了一个异数，成了一道令人刮目相看又谈之色变的风景。
故事开始前的几年，安在天一直在苏联以向破译大师安德罗学习破译密码技术之名，从事隐秘的间谍活动。然后有一天，他被701总部突然召回，一个新的故事便应运而生。
原来是敌人的密码变了，于是，又有了安在天寻找黄依依和黄依依破译密码的故事。
黄依依生自东方，来自西方，她有神的智慧，有天使的一面，而在那个闭关锁国的年代，天使的一面似乎常常被误解为魔鬼的一面。
故事发生在二十世纪30年代的上海。1931年，对于处在白包恐怖中的地下组织来说又是雪上加霜的一年，这一年4月24日，中央政治局委员、中央特科负责人顾顺章变节。由此，上海地下组织遭到重创，设在上海的中央也被迫紧急撤离上海。一时间，上海的地下组织几乎有点群龙无首，发往苏区的情报一度也中断了。
然而，前方，正在加紧组织更大规模的第四次围剿。为了取得反围剿的胜利，转移到苏区的中央迫切地需要上海、南京等地下组织提供较为可靠的军事情报。正是在这种情况下，党中央派出特使前往上海，准备重振上海地下组织的活力和威力。不幸的是，特使到上海的行动暴露了，而唯一的知情者，安在天的父亲，却被软禁在某处，他怎么样才可以把情报传出去。
1983年军工“蓝鱼”工程发生泄密案件，刚成立不久的国家安全机关总部责成J省安全机关侦办。年轻侦察员马小东以保卫干事身份进入202厂内线侦察，遇到之前有一面之缘的冯书雅，因执行任务需要，马小东放弃了这段感情。我国安内外配合，一举破获了间谍组织。可是，协助过马小东的工程师陈其乾意外失踪，很可能被间谍组织杀害。陈其乾在失踪前不久刚与冯书雅结婚。马小东对陈其乾遗腹子承志的关爱打动了冯书雅，两人组成了家庭。2013年，承志留学回国，冯书雅也成为了202厂总工程师，肩负军工“大船”工程分系统项目。此时陈其乾“死而复生”，已成为间谍的他将承志、冯书雅卷入间谍行动。马小东在国安安排下打入间谍组织，在与昔日友人和间谍组织的斗智斗勇中，凭着对国家和家庭的爱与忠诚，胜利完成了任务，保护了“小家”、守护了“大家”。
东南沿海，我军就要三军联合演习，由此，围绕着我导弹发射的保障与干扰等核心问题，雷和平等我国安人员与某海外间谍机关特务，展开了一场你死我活的生死大比拼。雷和平等接到我海外密报，某海外间谍组织诺亚山庄，特地制定了代号为“”行动，派遣间谍潜入大陆，搜集我导弹机密资料、破坏我导弹发射。
此时，望海市国际经贸洽谈会正隆重召开，一批间谍乘机混入。其中，就有代号“乖乖兔”的范青春，他以投资顾问的身份，前来与研制我导弹“K4”技术的快线网络公司考察，而快线的总经理丁欣如，则是范当年插队时的恋人，雷和平也是他们插队时的好朋友。就此，雷和平与打着寻亲与投资旗号的老朋友范青春，明里暗中，亲情与敌我双重较量交叉起伏，一直在变化进行着一次次斗智斗勇的“非常接触”。范青春不断调动“喜鹊”、“观察者三号”等间谍迷惑雷和平等人，而此间还有号称“港岛一狐”的奸商林黄可馨和她助手何小绿的搅和，现代青年“电脑疯子”徐文正“另类”举动不断，IHC东亚间谍机关琪琪以交际花身份频频诱惑出击，还有我某金融干部黎仁龙境外下水与胆小自首，等等，都使得案情波云诡谲，险象环生，一度使得雷和平等差点迷失了主方向。
在老厅长帮助下，雷和平设计了“非常接触”计划，决定以假装提前行动引蛇出洞。此举果然奏效，大小间谍纷纷浮出水面。而在一次被敌方下套陷害的过程中，雷和平发现，原来自己的对手就是范青春。范青春妄图借丁欣如女儿与年轻舰长杨帆的恋人关系窃取我机密，以及组织各方间谍，利用高科技电子技术方法进行自杀性疯狂反击等动作，都终被雷和平等—一化解。演习准时进行，范青春等亲自上阵对我方导弹实施强磁场干扰，雷和平从天而降，将其当场抓获。真相大白：范青春、黎仁龙等竟然都是双重间谍，同为诺亚山庄和IHC东亚间谍机关服务。而我们的一位国安战士也因此献出了宝贵的生命，她就是林黄可馨助手、那位看似很傻却极有心机的何小绿。国际经贸洽谈会圆满闭幕。与此同时，雷和平的助手肖一丁已取得诺亚山庄信任，正准备潜入大陆执行新的“S计划”
1969年冬季，中国北方边境地区某日夜，女知青付东篱因挑起两村械斗闹出人命，在我边防部队、公安、民兵追捕下跳入边境界河。
付东篱在公海被境外间谍机关意外救起，被培养成为一名间谍。随后，付东篱在伽亚国成功地刺杀了“世界轻武器之父——卡西莫”，闻名于世界间谍界；因在特维学校的“桃色事件”轰动整个间谍界；因潜入中国境内窃取我火箭基地资料和在太平洋“南斯岛”窃取“蓝宝石计划”令同行们侧目。这名华裔女谍先后在世界各地进行着卧底、窃取、策反、暗杀等间谍行径被业内誉为“狂花女谍”。
该剧以当前反对为大背景，从全新的视角讲述一个撼人心魄的现代故事：在国际势力的支持和纵容下，原台湾军情局行动部门间谍李肖，组织了一个国际分裂组织“铁血同盟会”并担任行动顾问，悄悄潜入中国大陆，意欲趁某国重要代表团访华之际，利用航模飞机爆炸，实施暴力暗杀活动，破坏两国关系。同进李肖还利用曾在大陆上过大学的女儿李曼秋对其同学—我参加军事演习的导弹部队指挥官洪越实施策反，妄图制造误射导弹，袭击某大国的军事冲突。达到分裂祖国、破坏我国安定团结的政治局面。进而达到使势力从中渔利的罪恶目的。
故事从海州市街头发生的一起神秘的枪战展开。接着，在人口密集的闹市区又接连发生了
五起爆炸案，却无一人伤亡。以冷锋为首的侦察员们警觉到这种没有目标和目的的爆炸案决非普通的犯罪分子所为，立刻开始对这一系列的破坏活动做出详细的调查和追踪。这一系列疑云重重的事件背后是否隐藏着更大的阴谋？
真相逐渐浮出水面，原来，两只装有高科技军事机密的两个钛金属盒被境外老牌间谍秃鹰盗走。
一阵刺耳的电话铃声将林云飞从睡梦中惊醒，电话中传出副科长董智超急促的声音：“八所秦工程师在火车站丢失了装有重要科研项目的包，此事引起上层的格外的重视，你速赶到铁路公安局。”林云飞与侦察员曹阳驱车赶到铁路公安局时，董智超告诉林云飞，公安已经破案了，是一起普通的盗窃案，让林云飞与公安做好收尾工作。林云飞在观看对小偷的审问录像时，发现了破绽，并迅速报告了处长洪子城。有着丰富侦破经验的洪处长敏锐意识到这很可能是一件间谍案，决定接手此案，并迅速采取了措施。
该剧通过境外间谍机关不择手段拉拢策反我方要害部门人员进行情报窃密的故事，揭示了尖锐复杂的隐蔽敌情，展示了惊险曲折的当代反间谍斗争。该剧提醒人们：间谍机关正时刻都在窥视着中国，为了获取情报，他们针对一些人的弱展开了险恶的阴谋：跟踪窥视、窃听窃照、金钱诱惑、利欲勾引、女色陷阱、栽赃陷害......自私与贪欲都会给间谍分子可乘之机。
中国某沿海小城渤北，是几家重点军工单位的所在地。历来是境外间谍组织窥伺的目标。
有一天，渔船打捞上一个生命垂危的年轻人，在他身上藏着带有我军工机密的电脑芯片。立刻引起安全机关的格外的重视，侦查二处处长粟丹带领侦查员温暖，段军等人展开调查。可当年轻人被救醒后，却因为头部遭到剧烈撞击而失忆了。与此同时，在医院附近出现了境外间谍人员的身影，不时寻找时机企图对年轻人灭口。
长平市机场，经验比较丰富的的飞行员赵志强，机敏地避免了一场重大 事故。飞机着陆后，人们发现油箱中被加入了遇热速熔的化学成分，如非及时有效地发现采取一定的措施，定然机毁人亡。而核心问题是，乘坐这架飞机的一位人刚刚视察完长平集团113研究所即将完成的研究项目——K2导弹制导系统，准备离开并向中央汇报，择日进行演习，这起事故很可能涉及国家安全问题
安全局侦察队队长在带队执行抓捕代号为“猎豹”的间谍行动中，意外发现对方要偷带出境的竟是“星讯六号”卫星的设计的具体方案。保密局接到中央指示，会同安全局、公安局成立专案检查组，组长由保密局督查处处长武梅担任。检查组对卫星研发机构322所展开调查
港口城市海昌,是一个以海洋科技为先导快速地发展起来的新兴沿海城市,这里不但是我国走向海洋的前沿阵地,也是境外间谍组织重视的焦点。国家安全局一名侦查员在执行任务时失踪，引起了省厅格外的重视，李厅长指派经验比较丰富的武梅率专案组赴海昌追查事件真相：敌我双方的较量随即在出海测试的“探索一号”工作船上展开。
不久，一艘渔船在“探索一号”工作船的测试海域意外打捞起一个神秘的海底装置——“水母”。深海研究院立即组成以副总工程师岳诚为首的科研小组，对该装置进行破解。境外间谍组织头目彼得森获悉“水母”丢失后，紧急责令潜伏海昌多年的海洋俱乐部总经理王维韬，不顾一切代价夺回“水母”芯片。
专案组在挫败了间谍组织的一系列行动，抓获海昌间谍组织骨干王维韬，但武梅发现事件背后隐藏着一个更加令人震惊的阴谋——水母计划，境外间谍组织已将多枚“水母”投放到我国海域，目的是窃取我国海洋信息环境与资源信息，而执行“水母计划”的“钓鱼者”身份神秘。
武梅抽丝剥茧耐心侦察，终于迫使“钓鱼者”原形毕露，双方随即展开了生死较量。最终，武梅率领专案组查获了“水母”的秘密测试厂、捣毁了信号传输基站，“钓鱼者”落网，“水母计划”彻底破产。
航班在高空飞行。一个客人非要打电话，却在空姐李小晚制止时忽发脑水肿不治而亡，手机被放入李小晚皮箱。死者王奇系保密单位研究员，涉嫌窃取与境外交易。国安局派一名侦查员以其弟“王浩”的身份卧底，意将犯罪分子一网打尽。王浩的到来引起境外等待跟王奇交易间谍组织的注意，先后派出王浩情人和仇家试验王浩真伪。飞机上拨打的电话是重要线索，为这部手机李小晚和王浩先结怨，再结缘。随着侦查任务走向核心，王浩想到自己工作的危险性，但他决定尽最大可能保护爱人安全。王浩看着李小晚不断被敌人利用却无法据实相告，心如刀割。他清晰清楚自己的任务就是保卫国家安全。所幸在大是大非面前，李小晚选择了国家利益。三年后，王浩接到一份新的命令，口令是“着陆开机”。在机场，王浩看到李小晚款款而来的身影。
国际能源会议即将在滨海市召开，为了破坏这次会议，搅乱中国未来的能源战略部署。滨海市国家安全局侦察处副处长石清泽率领部下与该间谍组织展开了一场高端的心理战、技术战…… “黄蝶”梵一平是间谍组织的骨干，他部署恐怖破坏方案的同时对石清泽展开心理战：派季少峰去接近石清泽的女朋友——报社专栏作家肖子茹，通过季少峰的弟弟——电脑高手阿伦频频向石清泽发送骚扰恐吓短信，欲从感情上和精神上摧毁石清泽,故意透漏一些误导线索，企图将国安调查工作引入歧途，.石清泽通过理性分析决定将计就计.. 洞悉了间谍组织最终阴谋的石清泽毅然举枪，指向了准备启动爆炸装置的“红蝶”…
苏菲是医科大学的高材生，毕业后分配到人民医院当了医生，非常崇拜刚刚学成归国的外科权威秦雨轩。秦隐瞒了自己有家有室的真相，引诱苏菲与他发生了关系。医院办公室主任李瑞生是间谍组织的骨干，在发现苏菲的隐私之后，威逼利诱苏菲成为了一名间谍份子并将她派往研制核潜艇低噪音螺旋浆的海军851厂医务室潜伏。残酷的抉择接踵而至，于是，她成为一名双面女人，一名时时在双重人格中挣扎的女间谍。
苏菲（张歆艺饰）是医科大学的高材生，毕业后分配到人民医院当了医生，非常崇拜刚刚学成归国的外科权威秦雨轩。秦隐瞒了自己有家有室的真相，引诱苏菲与他发生了关系。
得知真情的苏菲千方百计要做掉胎儿。阴差阳错，孩子还是来到了人间。苏菲为隐瞒视听，秘密地把孩子寄放在一户关姓人家抚养。
医院办公室主任李瑞生是间谍组织的骨干，在发现苏菲的隐私之后，威逼利诱苏菲成为了一名间谍份子并将她派往研制核潜艇低噪音螺旋浆的海军851厂医务室潜伏。
残酷的抉择接踵而至，于是，她成为一名双面女人，一名时时在双重人格中挣扎的女间谍。
掌握核心机密的851厂总工程师张平凉（王志飞饰）英俊儒雅，在接触中苏菲对他日渐有了一种特殊的好感，但她却清楚自己不能爱上他；而代理厂长王凯（刘斌饰）对于众人眼里热心善良的苏菲展开了追求，迫于秘密和儿子都被特务组织所掌控，内心万般煎熬之下苏菲答应嫁给自己并不爱的王凯，从此心中明明喜爱张平凉的她一面要与王凯“恩爱非常”，一面又要通过王凯窃取机密。她在间谍的泥潭中越陷越深，在情感和良知的天秤上不断失衡而沉沦。
新中国自主研究的“龙兴工程”进入攻坚阶段，为保护“龙兴工程”，我军驻燕宁某部队决定补充新生力量。王斌，楚静，肖天明和雷鹏成为了“卫龙行动队”的战士。韩晓琳没有正真获得王斌的承诺，郁郁寡欢地到苏联进修戏剧，没想到却被间谍组织陷害，强拉下水，踏上了一条不归路。
王斌，烈士的遗孤，父母在新中国建立的前夜，为保护新生的人民政权而壮烈牺牲。他青梅竹马的初恋韩晓琳，一直在等待他的求爱。然而大学毕业的傅斌，却决心继承父母的事业。新中国自主研究的“龙兴工程”进入攻坚阶段，为保护“龙兴工程”，我军驻燕宁某部队决定补充新生力量。王斌，楚静，肖天明和雷鹏成为了“卫龙行动队”的战士。韩晓琳没有正真获得王斌的承诺，郁郁寡欢地到苏联进修戏剧，没想到却被间谍组织陷害，强拉下水，踏上了一条不归路。韩晓琳“留学”归来，再次面对自己的亲人和傅斌。在王斌等人的努力下，韩晓琳的记忆被唤醒。当一切落下帷幕，韩晓琳选择了自杀。
为对大陆各地做最后抵抗，筹集了一批黄金计划由香港晏先生旗下远东航运公司的轮船“大丰号”送往国军总部，而负责押运这批黄金的人便是我当地下情报员黄以轩的父亲，在黄以轩的劝说下，黄父决定在押运这批黄金的途中领船投奔，却在实施计划的时候被特务孙世安识破，报告给了情报机构，使得黄以轩的一家老小死于国军手下，黄父也在激战中被黄以轩误杀。黄以轩于孙世安就此结下深仇。
情报机构安放定时炸弹，造成“克什米尔公主号”空难。我国政府派出特使前往案发地，调查事件真相。与此同时，已经在总部反间谍局任处长的黄以轩被派往案发地，通过那里的反间谍网络追查真凶。而作为情报机构的高级特工，孙世安也在此时接受了掩盖事件真相，并安排善后工作的任务。
黄以轩恰巧落脚在“大丰号”的东家——晏先生家，对“克什米尔公主号”的惨案，晏先生爱憎分明，对黄以轩的任务晏先生也十分支持。
有一次，黄以轩尾随并制服了孙世安，让其坦白杀死刘茵和黄以然的全部真相，但孙世安坚称与自己无关，且黄以轩的女儿没有死，只是下落不明。
在我国官方掌握了大量证据，迫使港英当局对“克什米尔公主号”事件的调查逐步接近真相的同时，黄以轩获得的情报则进一步将庞大的特务网络暴露出来，这让在香港的情报资源受到慢慢的变大的威胁，让孙世安所谓的善后工作难以“善后”。
“克什米尔公主号”事件的结局，是港英当局迫于我方压力，将大批特务驱逐出香港。孙世安虽不在驱逐名单之列，但也只好同期撤离香港。黄以轩达成目标后也返回大陆。
黄以轩回到了北京总部。他在香港的工作受到肯定和表扬，而在执行任务是的一些解决方法却遭到了某种质疑。晏先生的女儿通过高层特别批示，与黄以轩结婚，被安排到了外交部工作。
黄以轩从总部接受命令，保护一个重要人物回国。此时，黄以轩收到一封孙世安通过晏先生转来的信件，信中为寻找女儿提供了新的线索。
孙世安从黄以轩丢失的笔记本中得知黄以轩的任务，他认定重要人物会搭乘晏先生公司的“阿格尼丝号”货轮。孙世安为此找到晏先生，要求晏先生一定不可以插手此事。
黄以轩利用采取下作手段胁迫孙世安女友入伙，企图策反孙世安。孙世安虽然同样对上司的卑鄙忿忿难平，结论却是即便如此也不能对不起“两蒋”的多年赏识和栽培。
孙世安判断失误，重要人物安全归国。黄以轩达成目标返回大陆。不久之后，孙世安派人以香港记者的身份前往北京，通过黄以轩和晏思扬接近在一家从事铀浓缩的秘密工厂工作的张国民。
黄以轩和总部都认为，来人是要完成方面没能完成的暗杀。他们的错误判断，使来人通过张国民得到铀浓缩工厂的相关数据。
黄以轩被调回北京为总部的训练班授课。在训练班中一女学员的相貌与儿时经历都与自己女儿十分相似，当黄以轩将这个女学员的情况告诉妻子的时候，妻子将自己已经掌握的情况和盘托出，他们高兴地得出结论，这个女学员就是黄以轩失踪多年的女儿。
此时，“乒乓外交”的序幕已经拉开。中央决定邀请美国乒乓球代表团访华。为此黄以轩再次接受总部的任务，前往香港保证美国人的顺利入境。
第26届联大通过决议，中国成功返回联合国。孙世安终于当上了情报站站长，他暗中计划绑架黄以轩的儿子到总部接受训练，让黄以轩的儿子长大后成为黄以轩的敌人。被识破后，孙世安职务被取消。新站长告知，高层失去了对孙世安的信任。
1988年，晏先生去世，黄以轩的妻子接过晏先生在的统战资源，与黄以轩在香港定居。黄以轩的儿子学成回国。继承父业进入总部工作，继续着父亲为完成的工作。
而黄以轩和孙世安这两个明争暗战了一辈子的人，在古稀之年也放下仇恨，对月品茗，相视一笑。
20世纪60年代的一个冬天。秘密回国参加我新型潜艇研究制造的华裔专家，在途经香港时遭到台湾特务的追杀，险些丧命。
北京的反间谍局立即分析情况，作出我内部存在的判断，并迅速展开调查。本以等待退休的许子风和年轻的反间谍局人员骆战，以及原在香港的外派人员蓝美琴组成三人小组，接受了此项任务。
许子风的三人小组开始查找内部存在的间谍，但并未取得明显进展。这时，香港忽然出现了一个来自台湾情报部门的投诚者但戈然，他声称自己能为北京提供有关间谍的情报。经过在香港的会面，许子风认为但戈然的身份基本可信。但戈然随后开始提供相关情报，情报明确地将负责潜艇制造的研究所所长马知远指认为间谍，这让所有人都大吃一惊。随后展开的针对马知远的一系列毫无结果的调查，使许子风开始怀疑但戈然提供的是一个假情报，目的是扰乱视线，把我方的调查引入误区。但戈然显然是要为了进一步证实自己情报的可信度，随即又提供新线索，使骆战抓获了周为民等准备在春节期间对北京进行爆炸活动的小特务。就在这个但戈然的可信度得到更多认可的时候，许子风忽然悟出了台湾情报机构真正意图：以假投诚者但戈然转移我们的视线，达到掩护真正间谍、为其下一步行动争取时间的目的。
为了敲山震虎，许子风一面要求与但戈然再次见面，一面放出口风，声称此次见面的目的是揭穿但戈然假叛逃的伎俩。果然，但戈然应约到达香港后便被台湾方面的枪手击毙。但戈然的死亡，既证实了其假投诚是一个圈套，也使许子风他们将内部间谍的最大嫌疑集中在了研究所保卫处负责人范仕成身上。
台湾方面在北京的另一个潜伏特务毛阳，也在加紧行动，目标仍然是我方的潜艇项目和协助工作的华裔专家。在蓝美琴和骆战的严密监控下，敌人再次暗杀华裔专家等一系列活动都被挫败了。眼看我潜艇项目接近尾声，范仕成和毛阳也感觉到了末日的临近。在台湾方面的指令下，他们疯狂的孤注一掷了：盗窃潜艇试验资料、暗杀许子风、摧毁潜艇试验车间、枪击华裔专家等，经过一番斗智斗勇的生死较量，许子风他们的三人小组使敌人的阴谋均以失败告终，成功抓获了长期潜伏的间谍范仕成，保证了华裔专家的安全和潜艇项目的顺利完成。
在这场隐秘而曲折的严酷斗争中，许子风的前妻李景走出了多年的心理阴影；他们的女儿许婉云与潜伏进来的特务陆一夫经历了一场危险而伤感的恋爱；骆战在斗争中逐步成熟；蓝美琴以她的聪慧睿智推动着三人小组的工作，并与骆战产生了爱情；许子风更是经受了巨大的困境，在国家安全和个人情感两者之间进行着艰难的抉择。当最终的胜利来临时，许子风一家三口重新恢复了和睦与温情，而蓝美琴却在除夕前夜接受了新的任务，不辞而别地远走他乡，这给骆战留下了深深的惆怅。
但是，他们心里都十分清楚，作为一个国家安全的保卫者，祖国的利益永远是第一位的。个人的命运与情感，必须无条件的服从于那个崇高而隐秘的使命。因为他们将用一生来履行那个内心深处的忠诚誓言。
爆炸成功以后，我国核导弹的研制也已确定进入了最后阶段。敌对势力对此极为关注。台湾安全委员会所属的101和102两个特务机关，分别积极进行空中侦察和渗透破坏活动。反间谍总部受命在此期间务必采取比较有效措施，打击特务活动，确保核导弹研制工作的安全。
为此，总部崔志国局长和反间谍专家许子风，共同制定了一个绝密计划，在严防死守的同时，利用台湾101和102两个机关长期存在的矛盾，用假情报从内部瓦解敌人，彻底瘫痪这两个机关的特务活动。作为这个计划的重要部分，我驻香港反间谍人员朱学峰故意露出破绽，落入101香港情报站站长罗建成的手中；同时，长期在我监控之下的潜伏特务杜仙萍，也被巧妙“招进”总部，成为许子风的助手。许子风与杜仙萍的父亲苏崇亮，以及蓝美琴的父母在解放前曾经一起从事我党地下情报工作。利用这种特殊关系，许子风很快获取了杜仙萍的信任，利用杜仙萍将一个假情报传递给了101机关。
这个假情报指控102机关的高层罗将军是“鼹鼠”，于解放前就已投靠大陆。101早欲接管102主导的空中侦察项目，这个假情报正中其下怀，他们利用这个情报立即逮捕了罗将军，并想借此彻底将102取而代之。102主任黄弘明深知此中玄机，大有唇亡齿寒之感，决定不惜代价证明罗将军的清白。而要达到这个目的，则必须找到由罗将军单线操控、长期潜伏大陆代号“子21”的特务。罗将军却因对黄弘明的戒心，以及担心暴露已经接近我核导弹研制单位的“子21”，断然拒绝了。无奈之下黄弘明转而找到罗将军之子罗建成，让其利用101的资源寻找“子21”，并派出手下周福林赴香港协助工作。
